Una MasterPage in ASP.NET 2.0 può essere associata ad una pagina in modo dinamico direttamente nell'ambito dell'event handler dell'evento PreInit della pagina. Infatti questo evento viene lanciato prima ancora che l'HTTP handler della pagina cominci effettivamente il suo lavoro. L'evento PreInit serve proprio per modificare e impostare i parametri di funzionamento di una pagina prima che questa venga processata.
Per associare una MasterPage ad una pagina via codice, occorre valorizzare la proprietà MasterPageFile dell'oggetto Page. Questo metodo è equivalente all'impostazione dell'attributo MasterPageFile nell'ambito della direttiva @Page.

void Page_PreInit(object sender, EventArgs e)
{
    string currentMasterPage = "Default.master";
    if(Page.Request["Master"] != null)
        currentMasterPage = Page.Request["Master"].ToString();
    this.MasterPageFile = currentMasterPage;
}