Benchè non sia proprio un'accoppiata vincente, ASP.NET e MySQL possono dare il meglio di sè insieme.
La strada più semplice per farli funzionare è sfruttare i driver ODBC e ODBC.NET. In questo caso basta far riferimento alla classi del namespace System.Data.Odbc.
Un approccio che è in grado di garantire performance migliori è invece quello che passa per OLE-db e le classi contenute nel namespace System.Data.Oledb. In questo caso l'accesso ai dati è identico a ciò che si fa con Access, con la variante della stringa di connessione.

Infine la soluzione ottimale consiste nell'usare il managed provider ByteFX.Data, creato nativamente per MySQL e quindi più performante.
Si scarica da
http://sourceforge.net/projects/mysqlnet/

e mette a disposizione, sfruttando le stesse interfacce su cui ogni managed provider si basa, le stesse classi, ovviamente con nomi differenti e sfruttando un namespace differente, ovviamente.

Per approfondimenti si veda:

#410 - Connessioni ad Access con ASP.NET
http://www.aspitalia.com/liste/usag/script.aspx?ID=410

  #352 - Accedere a MySQL con ODBC.NET e ASP.NET
http://www.aspitalia.com/liste/usag/script.aspx?ID=352